MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii PV

Total Repeats: 349

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008512	GTTT	2	8	9024	9031	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008512	T	8	8	9050	9057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008512	AAT	2	6	9064	9069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008512	TAA	2	6	9072	9077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008512	ATT	2	6	13897	13902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008512	A	14	14	13905	13918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008512	AATTT	2	10	13949	13958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008512	TTA	2	6	13969	13974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008512	A	12	12	13989	14000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008512	GAAA	2	8	14001	14008	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008512	A	8	8	22384	22391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008512	ATTTTT	2	12	22395	22406	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008512	T	17	17	22402	22418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008512	A	9	9	24537	24545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008512	TTAA	2	8	24551	24558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008512	A	8	8	24568	24575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008512	A	8	8	24591	24598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008512	TAT	2	6	24607	24612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008512	T	10	10	24650	24659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008512	A	7	7	30203	30209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008512	TAT	2	6	30210	30215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008512	T	9	9	30220	30228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008512	TAG	2	6	30232	30237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008512	TTTAA	2	10	30240	30249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008512	TTA	2	6	30263	30268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008512	T	8	8	30271	30278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008512	TAA	2	6	30284	30289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008512	ATTTT	2	10	30291	30300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008512	T	10	10	30297	30306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008512	A	8	8	30307	30314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008512	TAA	2	6	35384	35389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008512	CGG	2	6	35428	35433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008512	A	6	6	35434	35439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008512	A	8	8	37217	37224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008512	T	6	6	37236	37241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008512	T	6	6	37269	37274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008512	AAT	2	6	37291	37296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008512	A	11	11	37324	37334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008512	T	6	6	37338	37343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008512	A	9	9	37344	37352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008512	ATA	2	6	37364	37369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008512	T	9	9	37388	37396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008512	A	13	13	37397	37409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008512	AGTTT	2	10	37446	37455	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008512	ATA	2	6	37458	37463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008512	AT	3	6	37507	37512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008512	T	11	11	37512	37522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008512	A	11	11	37532	37542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008512	AGT	2	6	37636	37641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008512	ATC	2	6	37669	37674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008512	ATGA	2	8	37675	37682	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008512	TA	3	6	37702	37707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008512	T	11	11	38180	38190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008512	A	6	6	38191	38196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008512	TAT	2	6	38201	38206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008512	ATT	3	9	38213	38221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008512	T	6	6	38220	38225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008512	T	9	9	38229	38237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008512	TA	3	6	38244	38249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008512	A	12	12	38267	38278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008512	AT	3	6	38281	38286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008512	TAAA	2	8	38294	38301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008512	ATT	2	6	41689	41694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008512	A	12	12	41703	41714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008512	T	6	6	41724	41729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008512	ATTT	2	8	41732	41739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008512	T	8	8	41737	41744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008512	ATT	2	6	42438	42443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008512	TAT	2	6	42454	42459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008512	ATA	2	6	42469	42474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008512	A	6	6	42493	42498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008512	A	6	6	42500	42505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008512	AT	3	6	42531	42536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008512	TAA	2	6	48085	48090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008512	A	8	8	48089	48096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008512	TATT	2	8	48117	48124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008512	TTTAA	2	10	48125	48134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008512	TTTTAA	2	12	48142	48153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008512	TAA	2	6	48165	48170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008512	ATT	2	6	48171	48176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008512	A	8	8	48183	48190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008512	ATTA	2	8	48195	48202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008512	TAA	2	6	48288	48293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008512	TAG	2	6	48308	48313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008512	CGTT	2	8	48359	48366	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008512	TTA	2	6	48375	48380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008512	ATT	3	9	48384	48392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008512	TAA	3	9	48460	48468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008512	ATA	2	6	48484	48489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008512	TAA	2	6	48506	48511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008512	AT	3	6	48522	48527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008512	A	11	11	48552	48562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008512	T	6	6	48563	48568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008512	TAATT	2	10	52965	52974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008512	A	9	9	52998	53006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008512	T	8	8	53030	53037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008512	T	10	10	53039	53048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008512	A	9	9	53055	53063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008512	ATTT	2	8	53071	53078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008512	T	13	13	53097	53109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008512	AT	3	6	53116	53121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008512	T	8	8	53121	53128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008512	A	7	7	53138	53144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008512	GTAG	2	8	53168	53175	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008512	GGT	2	6	53202	53207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008512	TAG	2	6	53314	53319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008512	T	7	7	53374	53380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008512	CATT	2	8	53404	53411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008512	TA	3	6	53419	53424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008512	TTA	2	6	53440	53445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008512	T	6	6	53460	53465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008512	ATT	2	6	53474	53479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008512	TTG	2	6	53495	53500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008512	ATT	2	6	53511	53516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008512	T	8	8	53529	53536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008512	T	10	10	54367	54376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008512	TA	3	6	54379	54384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008512	ATA	3	9	54390	54398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008512	A	7	7	54400	54406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008512	TTTAT	2	10	56230	56239	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008512	AGT	2	6	56245	56250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008512	T	8	8	56254	56261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008512	GTA	2	6	61180	61185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008512	TA	3	6	61229	61234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008512	T	7	7	65124	65130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008512	T	10	10	65133	65142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008512	A	9	9	65151	65159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008512	GTT	2	6	65376	65381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008512	TAT	2	6	65390	65395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008512	TAAA	2	8	67042	67049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008512	TTTAT	2	10	67052	67061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008512	T	15	15	67069	67083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008512	A	9	9	67084	67092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008512	CAAA	2	8	67093	67100	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008512	ATT	2	6	67112	67117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008512	A	9	9	67122	67130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008512	A	9	9	67137	67145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008512	T	11	11	67149	67159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008512	ATT	2	6	67169	67174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008512	T	10	10	67173	67182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008512	AAT	2	6	67200	67205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008512	AT	3	6	67216	67221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008512	T	6	6	67234	67239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008512	ATT	2	6	67240	67245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008512	A	6	6	67264	67269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008512	A	6	6	67284	67289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008512	ATAATT	2	12	67309	67320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008512	A	6	6	67351	67356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008512	AAAT	2	8	67380	67387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008512	TTA	2	6	67390	67395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008512	A	6	6	67411	67416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008512	TAT	2	6	67439	67444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008512	TTA	2	6	67552	67557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_008512	TTA	2	6	108811	108816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_008512	ATAAG	2	10	108839	108848	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.